Caracterización histopatológica y detección mediante reacción en cadena de la polimerasa en tiempo real de virus influenza aviar (H5N1), en órganos de aves marinas, ingresados a la unidad de morfología y diagnóstico entre los años 2015 a 2025

Abstract

La influenza aviar de alta patogenicidad (IAAP) ha implicado un gran riesgo para la fauna, la salud pública y la economía, ya que está distribuida mundialmente gracias a las aves migratorias, es altamente contagiosa y mortal, afectando a aves de producción, aves silvestres y mamíferos. El objetivo de esta investigación fue caracterizar histopatológicamente y detectar mediante qPCR el virus de influenza aviar (H5N1), en órganos de aves marinas, ingresadas a la Unidad de Morfología y Diagnóstico entre los años 2015 a 2025. Para esto, se ocuparon muestras de tejidos obtenidos en necropsias y las que presentaron lesiones histopatológicas (evaluados con un histoscore para la graduación de las lesiones) características de influenza aviar se sometieron a qPCR para la confirmación diagnóstica del agente. Se analizaron 200 muestras correspondientes a 40 casos de diferentes especies de aves marinas, los órganos más afectados fueron el hígado y pulmón, con trastornos inflamatorios, necróticos y circulatorios. De todas las muestras con lesiones sugerentes de IAAP (44 muestras en total), se seleccionaron 13 muestras para realizar qPCR, pero todas resultaron negativas debido a una baja concentración y pureza de la extracción de ARN. Los hallazgos observados son concordantes con las lesiones descritas en literatura para IAAP, pero al no poder detectar el agente en qPCR limita la confirmación de este. La principal limitación fue la degradación del ARN por la conservación de las muestras en formalina por periodos prolongados y la posible falla en el partidor o técnica utilizada. Como conclusión, si bien las lesiones histopatológicas observadas eran sugerentes de IAAP, no se pudo confirmar la presencia del virus a través de qPCR, esto destaca la importancia de tener en consideración las variables que pueden disminuir la calidad del ARN y por ende, la eficacia de las pruebas moleculares.

The high pathogenic avian influenza (HPAIV) has posed a significant risk to fauna, public health and the economy due to its worldwide distribution via migratory birds. It is highly contagious and often fatal, affecting poultry, wild birds and mammals. The objective of this research was to perform histopathological characterization and detection of the avian influenza virus (H5N1) by qPCR in organs of seabirds submitted to the Morphology and Diagnostic Unit between 2015 and 2025. To detect the virus, tissue samples were obtained during necropsies and those that showed histopathological characteristics lesions (evaluated using a histoscore for lesion grading) of avian influenza were subjected to qPCR for diagnostic confirmation of the agent. A total of 200 samples from 40 cases of different seabird species were analyzed, the most affected organs were the liver and the lungs, presenting inflammatory, necrotic and circulatory disorders. From the 44 samples with lesions suggestive of HPAIV, 13 were selected for qPCR, but all tested negative due to low RNA concentration and purity. The histopathological findings were consistent with those described in the literature for HPAIV, but the inability to detect the virus by qPCR limited its confirmation. The main limitation was RNA degradation caused by prolonged formalin preservation and potential issues with the primers or technique used. In conclusion, although the histopathological lesions observed were suggestive of HPAIV, the presence of the virus could not be confirmed by qPCR. This highlights the importance of considering variables that may reduce RNA quality and consequently, the effectiveness of molecular tests.